借款协议事后补偿是可以的，只要协议符合合同生效的形式要件和实质要件，就具有法律效力。
一、签订借款协议需注意哪些问题
需要注意的是，借款合同的利息，有三种情况：
1、正常借款期限内的利息。法律规定“民间借贷的利率可以适当高于银行的利率，各地人民可根据本地区的实际情况具体掌握，但最高不得超过银行同类贷款利率的四倍（包含利率本数）。超出此限度的，超出部分的利息不予保护”。
2、逾期利息。超出合同约定还款期限的利息。
3、打官司判决后，迟延履行判决书的罚息。法律规定“被执行人未按判决、裁定和其他法律文书指定的期间履行给付金钱义务的，应当加倍支付迟延履行期间的债务利息”。
《中国人民银行关于取缔地下钱庄及打击高利贷行为的通知》民间个人借贷活动必须严格遵守国家法律、行规的有关规定，遵循自愿互助、诚实信用的原则。民间个人借贷中，出借人的资金必须是属于其合法收入的自有货币资金，禁止吸收他人资金转手放款。民间个人借贷利率由借贷双方协商确定，但双方协商的利率不得超过中国人民银行公布的金融机构同期、同档次贷款利率（不含浮动）的4倍。超过上述标准的，应界定为高利借贷行为。
二、借款合同后补的连带责任有效吗
借款合同后补的连带责任是有效的，因为这是在双方除此签合同以后经过自己平等协商而再次签订的。
《民法典》
第六百八十【连带责任保证】当事人在保证合同中约定保证人和债务人对债务承担连带责任的，为连带责任保证。
连带责任保证的债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的情形时，债权人可以请求债务人履行债务，也可以请求保证人在其保证范围内承担保证责任。
连带责任亦称“连带债务”。“民事责任”的一种。指数个债务人就同一债务各负全部给付的一种责任形式。即债权人可对债务人中的一人，数人或全体，同时或先后请求全部或部分给付的一种债务形式。如合伙债务的债权人，对于合伙成员的一人、数人或全体，均可请求其同时或先后，部分或全部地清偿合伙债务。