民法典中事实婚姻不能办理协议离婚，只能通过起诉离婚解除关系。协议离婚需满足合法夫妻身份、完全民事行为能力、离婚意愿、子女抚养安排和财产分割等条件，并合法合规。
法律分析
一、民法典中事实婚姻能否办理协议离婚
事实婚姻关系由于没有办理结婚登记，所以不能协议离婚，事实婚姻关系只能起诉离婚。
《最高人民关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释(一)》
第七条未依据民法典第一千零四十九条规定办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的男女，提起诉讼要求离婚的，应当区别对待：
(一)1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理。
(二)1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民应当告知其补办结婚登记。未补办结婚登记的，依据本解释第三条规定处理。
二、协议离婚的条件
1、协议离婚的男女双方须有合法的夫妻身份。
2、协议离婚的双方当事人须为有完全民事行为能力的人。
3、协议离婚的双方当事人须有离婚的合意。
4、协议离婚时必须对子女的抚养教育作出恰当、合理的安排，并达成一致的协议。
5、协议离婚时必须对夫妻共同财产的分割做出适当的处理。
6、协议离婚必须合法。首先，双方当事人离婚动机和目的应该合法，不能用离婚来规避法律，达到其他个人目的。其次，离婚协议的内容必须符合法律和。
拓展延伸
事实婚姻的法律地位与协议离婚的合法性
事实婚姻是指未经结婚登记，但以事实共同生活并具备夫妻关系的情形。在民法典中，对于事实婚姻的法律地位并未明确规定，因此在不同地区可能存在差异。然而，协议离婚是指夫妻双方在婚姻关系破裂后，经过协商达成一致并依法解除婚姻关系的方式。协议离婚在我国法律上是被认可和允许的，无论是事实婚姻还是正式登记的婚姻。因此，事实婚姻的夫妻双方同样可以通过协议离婚的方式解除婚姻关系。然而，具体的办理程序和法律效力可能因地区而异，需要根据当地的法律规定进行操作。总之，事实婚姻的法律地位与协议离婚的合法性是可以相互关联的，但具体情况需要根据当地法律进行判断和处理。
结语
事实婚姻关系由于没有办理结婚登记，只能通过起诉离婚来解除。然而，协议离婚是一种夫妻双方经过协商达成一致并依法解除婚姻关系的方式。根据我国法律，无论是事实婚姻还是正式登记的婚姻，协议离婚都是被认可和允许的。然而，具体的办理程序和法律效力可能因地区而异，需要根据当地的法律规定进行操作。因此，在处理事实婚姻的协议离婚时，应根据当地法律规定进行判断和处理。
法律依据
中华人民共和国民法典：第四章 离婚 第一千零九十二条 夫妻一方隐藏、转移、变卖、毁损、挥霍夫妻共同财产，或者伪造夫妻共同债务企图侵占另一方财产的，在离婚分割夫妻共同财产时，对该方可以少分或者不分。离婚后，另一方发现有上述行为的，可以向人民提起诉讼，请求再次分割夫妻共同财产。
中华人民共和国民法典：第二章 结婚 第一千零五十一条 有下列情形之一的，婚姻无效：
（一）重婚；
（二）有禁止结婚的亲属关系；
（三）未到法定婚龄。
中华人民共和国民法典：第六章 民事法律行为 第二节 意思表示 第一百三十 无相对人的意思表示，表示完成时生效。法律另有规定的，依照其规定。